Während Booth im Gefängnis landet, weil ihm der Mord an drei FBI-Agenten angehängt wird, zieht Bones Erpressung in Betracht, um ihn zu befreien. Gleichzeituig beschäftigen sich die Forensiker am Jeffersonian Institute mit einer ganzen Reihe von bizarren Fällen - zum Beispiel mit dem Tod eines kontroverden Radiomoderatoren und dem, eines mysteriösen Kreuzworträtsels. Diese Stafffel zeigt neben den beliebten Gastauftritten von ryan O' Neal und Cyndi Lauper auch die herausragende Film Noir indpirierte 200. Episode.