Wo reguläre Klontruppen überfordert sind und Jedi-Ritter für den Einsatz nicht in Frage kommen, werden die härtesten und besten Krieger der Klonarmee eingesetzt: Die Republic Commandos. Speziell geschult für den Einsatz weit hinter den feindlichen Linien, führen sie einen geheimen Krieg gegen die Widersacher der Republik. Loyal bis in den Tod und in ehrenvollem Respekt ihren Jedi-Generälen verbunden, führen sie jede Mission mit tödlicher Präzision aus, ohne Rücksicht auf ihr eigenes Wohl. Doch als die Klonkriege andauern und der Blutzoll der Commandos und ihrer Kameraden der regulären Klontruppen immer höher wird, beginnen sich die Elitekämpfer zu fragen, für wen und wofür sie ihre Leben aufs Spiel setzen ?