Um Verbrechen aus der Welt zu schaffen und die Sicherheit in Japan zu gewährleisten, setzt die Regierung eine Geheimorganisation ein: die DA, deren Mitglieder als "Lycoris" bezeichnet werden. Es handelt sich dabei um Waisenmädchen, die von klein auf darauf trainiert werden, jede Bedrohung der öffentlichen Ordnung zu neutralisieren. In ihren Schuluniformen ziehen sie bewaffnet durch die Straßen und sind zu allem bereit. Als Takina, eine junge Rekrutin, ihre Befehle missachtet, wird sie ins Café LycoReco versetzt, wo sie mit Chisato, der besten Agentin der Gruppe, zusammenarbeitet. Wird es den beiden Teenagern, die ihre Rollen radikal unterschiedlich wahrnehmen, gelingen, zusammenzuarbeiten?